NIST RM 8461蛋白质组学的人类肝脏标准品分析:对于蛋白质同一性等定性测量,不能使用符合JCGM GUM的测量不确定度的常规评估和表达。表1列出了1619种蛋白质的身份,这些蛋白质是使用该领域专家普遍认可其可靠性的识别算法建立的。RM 8461中已鉴定的蛋白质是使用多种搜索引擎和多种样品制备方法从自下而上的蛋白质组学分析中推断出来的。通过重复注射(n=3)从8罐RM 8461的单个1mg制剂(n=三)中过滤通常鉴定的蛋白质。只有当满足以下条件时,蛋白质才包括在内:
•错误发现率(FDR)小于5%,
•整个测量集的光谱丰度优于20%CV(包括技术和过程重复分析),
•在RM 8461的整个生产过程中,使用Sequest HT、Mascot、MSAmanda和Byonic算法,从八个罐子的分层随机抽样中至少鉴定出三种独特的肽。
NIST确信表1中列出的1619种蛋白质的非认证定性值符合所有标准。
NIST RM 8461蛋白质组学的人类肝脏标准品非认证值:表1中以UniprotKB[3]登录号列出了RM 8461中已鉴定蛋白质的未认证定性值。此表也可从详细信息页面下载。该一致信息是基于当前可用信息的最佳估计,该信息由自下而上的LC-MS/MS分析和搜索引擎算法的比较确定;然而,这些证据不符合NIST的身份认证标准。
附加信息:质谱蛋白质组学原始数据已通过PRIDE[5]合作伙伴存储库存入ProteomeXchange Consortium[4],数据集标识符为PXD013608,项目DOI 10.6019/PXD031308。
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